Automaattinen vatsakalvodialyysi (Automatic Peritoneal Dialysis, APD) tehdään koneen avulla. Kone kontrolloi automaattisesti nestevaihtojen määrän, täyttää uutta nestettä vatsaonteloon ja tyhjentää käytettyä nestettä pois vatsaontelosta. Koneen käyttö on helppoa, ja koneessa on turvasysteemi, joka estää esimerkiksi ylitäytön.

Automaattinen vatsakalvodialyysi tehdään yleensä yöllä potilaan nukkuessa. Koneeseen laitetaan illalla yön aikana tarvittava nestemäärä, ja nukkumaan mennessä kytketään katetri koneen letkusysteemiin. Konehoito kestää yleensä 8-9 tuntia. Aamulla kone jättää noin 1,5 - 2 litraa nestettä vatsaonteloon, ja näin tälläkin menetelmällä dialyysi tapahtuu 24 tuntia vuorokaudessa. Illalla kone aloittaa toimintansa tyhjentämällä päivällä vatsaontelossa olleen nesteen pois. Joskus tarvitaan dialyysinestevaihto myös päivällä.